Responsables del servicio

Dra. Nuria Jiménez Hernández

Equipo

Loreto Ferrús

Llúcia Martínez

Mª Dolores Catalán

Alejandro Artacho

secuenciacion_csisp@gva.es

CSISP-FISABIO

Servicio de Secuenciación

Avda. Cataluña, 21 46020, Valencia (España) Tel. + 34 961 925 958

Horario de atención: 09:00 -18:00 horas

Servicio de Secuenciación

FISABIO-CSISP pone a su disposición un equipo de ultrasecuenciación Genome Sequencer FLX+System de última generación. El GS-FLX+ es la plataforma de secuenciación de ADN más avanzada del mercado y, a lo largo de los últimos años, se ha convertido en el estándar de excelencia en proyectos de secuenciación de nueva generación.

El Genome Sequencer FLX+ System proporciona más de 1 millón de secuencias de alta calidad por carrera y lecturas de 700 pb. El sistema está especialmente diseñado para la secuenciación de novo de genomas completos y transcriptomas de cualquier tamaño, para caracterización metagenómica de muestras complejas, estudios de resecuenciación y mucho más. El sistema GS FLX+ ha sido utilizado en proyectos de investigación que han dado lugar a cientos de publicaciones en revistas científicas.

Para más información sobre las aplicaciones de la tecnología ultrasecuenciación puede visitar la web: www.454.com, o bien, contactar con nuestro Servicio de Secuenciación.

Aplicaciones

El equipo de ultrasecuenciación Genome Sequencer FLX+ System del Centro Superior de Investigación en Salud Pública tiene numerosas aplicaciones en distintos campos de la biología. El sistema cuenta con una enorme versatilidad debido a la capacidad de procesado y la precisión y el tamaño de las lecturas obtenidas. A continuación se enumeran algunas de las aplicaciones más habituales:

     •   Secuenciación de transcriptomas

     •   Secuenciación de genomas eucariotas y procariotas completos

     •   Secuenciación de amplicones

     •   Secuenciación de HIV

     •   Metagenómica

Dirección de envío

Centro Superior de Investigación en Salud Pública (CSISP-FISABIO)

Servicio de Secuenciación.

Área Genómica y Salud

Avda Cataluña nº 21 46020 Valencia, Spain

Tel.: +34 961 925 958

Horario de atención: 09:00-18:00 horas

Cuando envíe una muestra, por favor mandenos un e-mail a la dirección: secuenciacion_csisp@gva.es indicando la compañía de mensajería utilizada y el número de referencia del paquete.

Preparación de Muestras

Formulario de solicitud: Cada muestra debe ir acompañada de un formulario de solicitud debidamente cumplimentado.

Calidad de DNA: El DNA debe ser de doble cadena, preferentemente purificado, bien mediante protocolos de filtración o purificación en columna. La ratio A260/280 debería estar normalmente en valores de  ~ 1.8 para que los resultados sean optimos. Con el fin de evaluar la concentración y la calidad del DNA, es importante correr 1ul de la muestra en un gel de agarosa al 2% junto con un marcador de peso molecular, como el de 1Kb, que sirva como referencia. Por favor, eviar una copia del gel bien por e-mail o junto con el formulario de solicitud, identificando claramente el contenido y cantidad de DNA de cada carrera.

Cantidad de DNA: Para proyectos de secuenciación de DNA genómico, se requiere al menos una cantidad de 2 µg de DNA a una concentración >= 10 ng/µL en TE buffer o agua. Es importante que el tamaño de los fragmentos sea >2Kb. Se recomienda que la cuantificación de la muestra se realice con Picogreen-Assay. Para cualquier otro tipo de muestras, por favor contacte con nosotros para más información acerca de los requisitos que deben cumplir.

Si su muestra no cumple los criterios señalados, la secuenciación de la misma utilizando nuestros servicios de secuenciación puede conducir a resultados no deseables y a la obtención de secuencias de baja calidad.

Instrucciones de envío

Embalaje de las muestras: Las muestras deben proporcionarse en agua o TE en un volumen mínimo de 15-20 µL y preferentemente en microtubos de 1.5 mL. Se recomienda sellar los microtubos con parafilm. Se recomienda colocar, hasta 6 microtubos de 1.5 mL (sellados con parafilm), en el interior de tubos de centrífuga de 50 mL. Para prevenir el movimiento de los microtubos de 1.5 mL durante el transporte, es aconsejable introducir trapicel/tissue en el interior del tubo de 50 mL junto con los microtubos.

Transporte de muestras: Las muestras pueden enviarse a temperatura ambiente, en hielo o hielo seco. Es recomendable el envío mediante servicios de mensajería express (24 horas) a la dirección de envio.

Descarga formularios

Formulario de solicitud (español) Customer Sample Questionnaire (english)

Formulario de solicitud

Adjunte un formulario de solicitud por cada muestra que envíe a nuestro Servicio de Secuenciación.